後來逐漸對球形玻璃表面能使物體放大成像的規律有了認識。
1590年，荷蘭和意大利的眼鏡制造者已經造出類似顯微鏡的放大儀器。
1611年 Kepler(克蔔勒)：提議復合式顯微鏡的制作方式。
1665年 Hooke(胡克)：「細胞」名詞的由來便由虎克利用復合式顯微鏡觀察植物的木栓組織上的微小氣孔而得來的。
1674年 Leeuwenhoek(列文胡克)：發現原生動物學的報導問世，並於九年後成為首位發現「細菌」存在的人。
1833年 Brown(布朗)：在顯微鏡下觀察紫羅蘭，隨後發表他對細胞核的詳細論述。
1838年 Schlieden and Schwann(施萊登和施旺)：皆提倡細胞學原理，其主旨即為「有核細胞是所有動植物的組織及功能之基本元素」。
1857年 Kolliker(寇利克)：發現肌肉細胞中之線粒體。
1876年 Abbe(阿比)：剖析影像在顯微鏡中成像時所產生的繞射作用，試圖設計出最理想的顯微鏡。
1879年 Flrmming(佛萊明)：發現了當動物細胞在進行有絲分裂時，其染色體的活動是清晰可見的。
1881年 Retziue(芮祖)：動物組織報告問世，此項發表在當世尚無人能淩駕逾越。
然而在20年後，卻有以Cajal(卡嘉爾)為首的壹群組織學家發展出顯微鏡染色觀察法，此舉為日後的顯微解剖學立下了基礎。
1882年 Koch(寇克)：利用苯安染料將微生物組織進行染色，由此他發現了霍亂及結核桿菌。
往後20年間，其它的細菌學家，像是Klebs 和 Pasteur(克萊柏和帕斯特)則是藉由顯微鏡下檢視染色藥品而證實許多疾病的病因。
1886年 Zeiss(蔡氏)：打破壹般可見光理論上的極限，他的發明--阿比式及其它壹系列的鏡頭為顯微學者另辟壹新的解像天地。
1898年 Golgi(高爾基)：首位發現細菌中高爾基體的顯微學家。
他將細胞用硝酸銀染色而成就了人類細胞研究上的壹大步。
1924年 Lacassagne(蘭卡辛)：與其實驗工作夥伴***同發展出放射線照相法，這項發明便是利用放射性釙元素來探查生物標本。
1930年 Lebedeff(萊比戴衛)：設計並搭配第壹架幹涉顯微鏡。
另外由Zernicke(卓尼柯)在1932年發明出相位差顯微鏡，兩人將傳統光學顯微鏡延伸發展出來的相位差觀察使生物學家得以觀察染色活細胞上的種種細節。
1941年 Coons(昆氏)：將抗體加上螢光染劑用以偵測細胞抗原。
1952年 Nomarski(諾馬斯基)：發明幹涉相位差光學系統。
此項發明不僅享有專利權並以發明者本人命名之。
1981年 Allen and Inoue(艾倫及艾紐)：將光學顯微原理上的影像增強對比，發展趨於完美境界。
1988年 Confocal(***軛焦)掃描顯微鏡在市場上被廣為使用。