醫院設有總部、四個門診部和四個社區服務站，專業設置齊全，設有47個臨床和醫療科室。擁有現代化的潔凈手術部、重癥醫學科、靜脈輸液調配中心和輻射全國的大型健康管理中心。是“中國婦科腫瘤疑難會診中心”，配有北京急救中心北苑急救站。承擔著中國航空工業集團公司50萬員工的職業病防治和醫療保健，肩負著大型飛行試驗的醫療保障和周邊654.38+0多萬居民的醫療保健任務。
醫院占地面積約28600平方米，建築面積73075平方米。南區建設將新增醫療室4.6萬平方米。建成後，醫院建築面積將達到654.38+0.2萬平方米。目前有床位1000張。醫院擁有壹流的醫療設備，其中醫療器械2358臺(套)，設備價值達2億多元。擁有3.0T超導磁共振、320排高端CT、全數字化乳腺攝影系統、數字減影血管造影(DSA)、數字x光機(DR)、進口高端彩超診斷設備、智能樓宇自控系統等現代化診療設備。
近年來，醫院從美國匹茲堡大學、北京大學、協和大學、華西等知名高校引進了壹批學科帶頭人和專家，構建了壹支結構合理、富有競爭力的人才梯隊，擁有醫技人員65438人+副主任醫師以上職稱人員0，230，239人，博士後5人，博士43人，碩士246人。
引進著名婦產科專家、博士生導師、中國抗癌協會副理事長、全國五壹勞動獎章獲得者高教授，聘請中國工程院副院長、原第四軍醫大學校長範院士、原衛生部副部長、原華西醫科大學校長、著名婦產科專家教授擔任名譽校長。
醫院堅持“在健康中求價值，在差異中求發展”的發展戰略，大力發展重點學科。口腔科、婦產科、神經內科是醫院的重點學科。依托華西強大的口腔實力，口腔科成為北京北部綜合性醫療機構中最大的口腔專科；醫院開設功能性、微創性、創傷性腦血管神經外科、腦脊液神經外科，並聯合神經內科、疼痛科、心身醫學科組成神經學科群；通過高端人才的引進，醫院建立了全國首個多學科疼痛科、衛生部首批癌痛規範化治療示範病房，積極建立舒適醫療體系，推動了“舒適醫學，無痛醫院”品牌的形成。在三級醫院開展了各種醫療項目，包括口腔無痛微創診療、牙種植、牙齒美容修復、婦科微創手術、復雜疑難疼痛診療、神經外科介入診療、神經內科中風診療、產科無痛分娩、高危孕婦綜合治療等技術。腦脊液疾病、帶狀皰疹後神經痛、煙霧病、面神經疾病、神經肌肉疾病的診療技術達到國內外先進水平。2013年初，成功完成亞洲首例漸凍人高危孕婦剖宮產手術。
醫院加強了與國內外各大醫學院校的合作。與中國科學院生物物理研究所共同成立“中國科學院北京轉化醫學研究所”；與中國醫科大學合作，建立中國醫科大學北京臨床學院和中國醫科大學航空總醫院聯合博士後培養基地；與華西口腔學院合作成立“華西口腔醫院361分院”；與慕尼黑大學祁鳴湖培訓中心合作，成立“德國航空總醫院祁鳴湖口腔種植培訓中心”；與阜外醫院合作建立心血管技術培訓中心；與蒙古國合作成為北京唯壹的“蒙醫來華交流定點醫院”；成立北京市第五神經病學會診中心和中華醫學會麻醉學分會疼痛診療培訓基地。
醫院高度重視科教工作，不斷提高技術創新能力。新成立了慢性盆腔痛、帶狀皰疹、煙霧病、口腔種植、腦脊液病、漸凍人病等臨床技能培訓中心和六個疾病研究室。近三年承擔北京市、朝陽區13專項，獲AVIC科技進步獎3項，發表SCI論文20余篇，在核心期刊發表論文近300篇。開展了廣泛的教學合作，與多所醫學院校建立了教學合作關系。醫院現有院士2名，博士、碩士導師壹批，承擔國家級繼續教育項目和北京市繼續教育項目近20項。不斷與國內外著名大學和醫療機構開展各種學術交流活動。
醫院秉承“尚德精通”的校訓，以“身心守護健康同行”為使命，堅持以患者為中心，堅持人性化服務，不斷優化服務流程，為患者提供高效、便捷、優質的服務，努力打造北京最值得信賴的醫院。通過強強聯合，醫院不斷引進國際先進醫療技術，朝著壹流現代化醫院的目標不斷前進。