與傳統的財務分析師手工或使用Excel等電子表格處理軟件進行財務分析相比，財務分析軟件作為財務分析專用軟件，包括但不限於以下功能:
1)財務分析軟件通過整合財務數據的能力，使財務分析師能夠方便地獲取財務分析所需的數據。
財務分析軟件通過財務數據集成能力克服了手工采集和維護財務數據無法或不方便的缺點，可以通過軟件接口采集和集成集團內不同用途、不同廠商、不同版本企業的財務相關系統的數據。根據財務分析軟件實現程度的不同，涉及的數據來源包括內部相關財務系統數據、內部管理報表數據、下屬企業上報的財務數據、外部可獲得的同業財務數據、上市公司披露的財務數據等。涉及的系統包括會計系統、出納系統、預算管理系統、資產管理系統、資金管理系統、合並報表系統等。涉及的處理包括不同會計準則、不同貨幣、不同賬戶和指標體系等的映射、轉換和集成。涉及的數據粒度包括報表數據、指標數據、科目數據、憑證數據、分錄數據等。，涉及的時間範圍應包括跨年度的歷史數據。
2)財務分析軟件通過內置的主流財務分析方法和綜合評價體系，為財務分析師提供先進的財務分析手段。
從財務分析指標來看，包括單指標分析、多指標綜合分析、財務模型分析等方法；從財務分析算法來看，包括比較分析、比率分析、因子分析、趨勢分析、標桿分析、企業綜合評價等。；從財務分析對象來看，包括對單個企業的分析與剖析、集團內企業的橫向比較、同業比較、行業標準或平均值以及其他外部對標。
3)財務分析軟件通過預定義的指標體系、分析報表體系和用戶自定義的能力，幫助財務分析師快速進行財務分析。
幫助財務分析師快速進行財務分析，通過用戶自定義的能力，滿足財務分析師針對分析對象和目的定義分析個性化指標和報表的需求。預定義的指標體系包括財務報表指標、財務比率指標、財務能力指標、財務效率指標、財務綜合評價指標等。預定義報表包括橫向比較分析報表，如分部報表、三大財務報表、各種分類財務報表和各種常用明細表。
4)財務規則的計算機處理能力，幫助財務人員監控財務數據，及時得到財務風險預警。
借助計算機規則處理能力，財務分析軟件可以自動監測財務數據，並在滿足預警條件時給出預警，可以有效支撐所轄企業財務風險監測的效果。財務風險監控的指標通常包括投資風險指標、債務風險指標、盈利能力風險指標、現金流量風險等。金融風險監控的計算機處理流程通常包括風險監控、風險識別、風險處置、風險跟蹤和風險評估。