第壹，公司罰款制度的合法性
公司的罰款制度必須合法合規，即符合相關法律法規。在我國，勞動法等相關法律法規對用人單位的處罰權進行了限制和規定。因此，公司在制定罰款制度時，必須確保不違反相關法律法規的規定。
二、員工同意的重要性
公司的罰款制度必須得到員工的認可，否則可能構成違法行為。員工的同意通常通過簽訂勞動合同或公司規章制度來體現。如果員工不同意罰款制度，公司無權對員工進行罰款。
三。罰款數額的合理性及理由
罰款數額和理由的合理性也是判斷公司罰款制度是否違法的重要因素。罰款數額要合理，不能太高，否則可能會侵害員工的合法權益。同時，罰款的理由應當合理、充分，不得任意或濫用罰款權力。
總而言之:
遲到罰款的公司是否違法，需要根據具體情況來判斷。如果公司的罰款制度是合法合規的，罰款的數額和理由是合理的，並且得到了員工的同意，那麽公司的罰款行為就是合法的。另壹方面，如果公司的罰款制度違反相關法律法規，或者未經員工同意，或者罰款金額過高，罰款理由不合理，那麽公司的罰款行為就可能構成違法行為。
法律依據:
中華人民共和國勞動法
第50條規定:
工資應當以貨幣形式按月支付給勞動者本人。不得克扣或者無故拖欠勞動者的工資。
第91條規定:
用人單位侵犯勞動者合法權益，有下列情形之壹的，由勞動行政部門責令其向勞動者支付工資和經濟補償，也可以責令其支付賠償金:
(壹)克扣或者無故拖欠勞動者工資的；
(二)拒不支付勞動者延長工作時間工資的；
(三)低於當地最低工資標準支付勞動者工資的；
(四)解除勞動合同後，未依照本法規定給予勞動者經濟補償的。
中華人民共和國(中國)勞動合同法
第85條規定:
用人單位有下列情形之壹的，由勞動行政部門責令限期支付勞動報酬、加班工資或者經濟補償；勞動報酬低於當地最低工資標準的，支付差額部分；逾期不支付的，責令用人單位按照應付金額50%以上100%以下的標準向勞動者支付賠償金:
(壹)未按照勞動合同的約定或者國家規定及時足額支付勞動者勞動報酬的；
(二)低於當地最低工資標準支付勞動者工資的；
(三)安排加班而不支付加班費的；
(四)解除或者終止勞動合同，未依照本法規定向勞動者支付經濟補償的。