公元1559年,中國有72個胡格諾教會,分別是新教和基督教長老會,以加爾文教為主。壹年後,胡格諾教徒的人數已經增加到30萬。同年,法國查理九世十歲即位,由王太後凱瑟琳攝政。她利用了當時法國貴族兩派的不和(壹派以東北部吉斯家族為首,依靠羅馬天主教會的支持;以西南部和中部的波旁家族為首的壹派信奉加爾文主義,並使他們互相制約以維護她的王權。1561年,她宣布停止迫害胡格諾派教徒,釋放被捕的新教徒,使得新教徒數量大增,被稱為“爭取最好的”。胡格諾派因與法國傳統舊宗教格格不入而受到宗教迫害,於是新舊宗教的信徒相互仇視,甚至在兩大貴族的煽動下發展成武裝對抗。這樣的情況持續了壹年多,終於在1,65432年3月爆發了“濕婆大屠殺”。原因是吉斯公爵正經過希瓦鎮,正好胡格諾教徒正在舉行禮拜,雙方發生沖突。吉斯公爵的武裝追隨者襲擊了他們,造成200多人死傷。這就是與天主教會的胡格諾戰爭,歷時三十余年,分三個階段,打了十場仗。聖巴塞洛繆大屠殺發生在1572年,也稱為聖巴塞洛繆節。據說那天巴黎所有的鐘聲同時響起,這其實是大屠殺的暗號。這壹殘暴行為持續了三天三夜,大屠殺仍在繼續。原本局限在巴黎的暴行甚至蔓延到了其他城市。如此殘酷的鎮壓胡格諾派教徒,是歷史上最汙穢殘忍的罪行之壹。不幸的是,它不僅沒有結束內戰,反而給內戰帶來了更多的沖擊。這種鬥爭壹直持續到查爾斯的下壹任國王亨利三世時代,成為(三個亨利)之間的(三角沖突)。所謂三亨利是指中庸之王——亨利三世;天主教的領袖——吉斯的亨利;胡格諾派的領袖波旁王朝的亨利。後來,國王亨利三世下令謀殺吉斯的亨利。沒想到吉斯的亨利被殺後,他自己也因為敵人的報復而遇刺身亡。因此,在1589年,唯壹幸存的波旁王朝的亨利如期繼位。但由於大部分法國人還是天主教徒,無法容忍胡格諾派的統治,所以亨利三世在1593年宣布自己是天主教徒,隨後在1594年進入巴黎成為國王亨利四世。1598年,法國國王亨利四世的序言中提到,他曾經是胡格諾派的領袖,但他皈依了羅馬天主教。他皈依的目的是頒布南特敕令,允許新教徒享有禮拜和信仰自由,甚至賦予他們武裝自衛的權利。所以胡格諾派把武裝自衛隊留在法國南部200多個城鎮作為國王的敕令。法王亨利四世頒布的南特敕令,確實充滿了宗教寬容的精神。傳說亨利四世曾經說過這樣壹句話:【巴黎很值得做彌撒。不管這句話是真是假,現在大多數歷史學家都接受了他改變信仰的事實。不過當時還是有零星的戰鬥。1610年,亨利四世遇刺,法國再次進入戰爭現場。很多法國人逃到鄰國甚至新大陸避難,直到1628年,胡格諾派的根據地拉羅舍爾被攻占,這是最嚴重的壹次零星戰鬥。1629年,胡格諾派在法國的政治影響力也瓦解了,但他們仍然以胡格諾派的形式存活了下來。總的來說,17世紀對於法國的胡格諾派來說還是壹個比較和平的時代。好景不長。17世紀末,法國國王路易十四頒布楓丹白露敕令,廢除南特敕令,宣布新教為非法。於是,大約20萬胡格諾派教徒大規模遷出,主要定居在英國、瑞士、荷蘭、普魯士等地。