第二種形式是獨立核算的分公司。如果分公司和總公司不在同壹家公司，中國企業在繳納地方稅時需要遵守屬地原則，即公司向當地稅務機關繳納地方稅。所以，如果總公司和分公司不在同壹個地區，那麽分公司就需要獨立申報企業所得稅。在這種情況下，分公司需要采用獨立核算的財務管理方式。所謂獨立核算，是指在分公司建立新的財稅制度。當然，分公司雖然構建了新的財稅體系，但畢竟不具備獨立法人資格，在稅務管理和財務管理過程中需要受到總公司的監管。
獨立核算的分公司在繳納所得稅時，壹般與總公司繳納的企業所得稅是分開的。所以分支機構在繳納企業所得稅前需要單獨開戶。在開設單獨的稅務賬戶時，需要註意壹些問題:壹是通過各種途徑了解分公司稅務登記所需的資料，根據資料進行資料準備，這是公司順利通過稅務審核的基礎。第二，要認真填寫稅務登記表。在填寫稅務登記表時，工作人員應始終保持認真的工作作風，使稅務登記表能通過審核。
當然，對於分公司來說，在繳納企業所得稅的時候，也可以自行納稅籌劃。通過稅收籌劃，可以減少企業所得稅的金額，對分支機構的資本積累有很大的幫助。分支機構要想提高自身的稅收籌劃質量，首先要了解稅收籌劃的基本知識。因為企業只有了解稅收籌劃的基本知識，才能達到高質量稅收籌劃的目的，所以分支機構財務經理加強對稅收籌劃專業知識的了解是非常必要的。
法律依據:《中華人民共和國公司法》第十四條規定，公司可以設立分公司。設立分公司應當向公司登記機關申請登記，領取營業執照。分公司不具有法人資格，其民事責任由公司承擔。公司可以設立子公司，子公司具有法人資格，依法獨立承擔民事責任。