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高通量測序的測序平臺

自從2005年454生命科學公司(2007年正式被羅氏收購)推出454 FLX焦磷酸測序平臺後,因為他們的旗艦產品系列毛細管陣列電泳測序儀遇到了兩個強大的競爭對手,曾經推出3730xl DNA分析儀的應用生物系統(ABI)的領先地位開始動搖,該儀器壹直占據測序市場的最大份額。壹個是羅氏的454測序儀。另壹個是2006年美國Illumina公司推出的Solexa基因組分析儀平臺。為此,ABI公司在2007年推出了自己的固體測序儀。這三個測序平臺是目前高通量測序平臺的代表。(見表1)公司名稱、技術原理、技術開發者的商業模式、Apply Biosystems(ABI)基於磁珠的大規模平行克隆和DNA測序方法Agencourt Private Genomics Company(APG)美國上市公司:出售設備和試劑獲利Illumina合成測序方法英國Solexa公司首席科學家戴維·本特利,上市公司:出售設備和試劑獲利羅氏大規模平行焦磷酸合成測美國454生命科學公司創始人喬納森·羅斯伯格(Jonathan Rothberg)列舉的是壹家公司:出售設備和試劑獲利。該產品已於2013停產。Helicos大規模並行單分子合成測序方法Stephen Quake,美國斯坦福大學生物工程師,上市:首次公開發行(IPO)2007年5月(P.S .由於平臺準確率低,公司於2012年宣布破產)Complete Genomics DNA納米陣列和組合探針錨定連接測序方法radoje drmanac私營公司,美國Complete Genomics公司首席科學家:投資4650萬美元,公司於2065438+年被華大基因收購表1:主流測序平臺概述

羅氏454焦磷酸測序

(焦磷酸測序)

Illumina Solexa合成測序

(通過合成排序)

Illumina基因組分析儀的測序原理

Illumina新壹代測序儀Hiseq 2000和Hiseq 2500具有高精度、高高通容量、高靈敏度、低運行成本等突出優勢,可同時完成傳統基因組學研究(測序和註釋)和功能基因組學研究(基因表達和調控、基因功能、蛋白質/核酸相互作用)。Hiseq是壹種基於單分子簇的測序技術,基於化學反應可逆終止的原理。在測序過程中,基因組DNA的隨機片段附著在光學透明的玻璃表面(即流動池)。經過延伸和橋接擴增,在流動細胞上形成了數以億計的簇,每個簇都是單個分子簇,具有數千個相同模板的拷貝。然後,用四種帶有熒光基團的特殊脫氧核苷酸和可逆終止SBS(邊合成邊測序)技術對待測模板DNA進行測序。

ABI固體連接測序

(通過連接的序列)

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