法醫職能
註冊會計師出具的審計報告不同於政府審計和內部審計的審計報告。作為獨立的第三方，對被審計單位財務報表的合法性和公允性發表意見。這種意見，具有取證功能，得到了政府及其部門和社會各界的廣泛認可。財政部門、稅務部門等政府相關部門主要依據企業提供的財務報表來了解和掌握企業的財務狀況和經營成果。財務報表是否合法公允，主要看註冊會計師的審計報告。股份制企業股東主要根據註冊會計師的審計報告，判斷被投資企業的財務報表是否公允地反映了財務狀況和經營成果，從而做出投資決策。
保護作用
通過審計，註冊會計師可以對被審計單位的財務報表出具不同類型審計意見的審計報告，從而提高或降低財務報表信息使用者對財務報表的信任度，在壹定程度上保護被審計單位的財產、債權人和股東的權益以及企業利益相關者的利益。例如，為了降低投資風險，投資者在投資前必須查閱被投資企業的財務報表和註冊會計師的審計報告，以了解被投資企業的經營和財務狀況。投資者可以根據註冊會計師的審計報告進行投資決策，可以降低自己的投資風險。
證明函數
審計報告是註冊會計師對審計任務完成情況及其結果的總結，可以顯示審計工作的質量，明確註冊會計師的審計責任。因此，審計報告可以證明審計工作的質量和註冊會計師的審計責任。通過審計報告，可以證明註冊會計師在審計過程中是否實施了必要的審計程序，審計意見是否以審計工作底稿為依據，發表的審計意見是否與被審計單位的實際情況相符，審計工作質量是否符合要求。通過審計報告，可以證明註冊會計師履行了審計責任。