國有獨資公司:
國務院或者地方人民政府授權本級人民政府國有資產監督管理機構履行出資人職責。
國有控股公司:
政府以國有資本投資企業，取得控股權，通過參與董事會制定企業的重大政策，但不直接參與經營活動。
2.不同的成立條件
國有獨資公司:
設立國有獨資公司，應當符合法律規定的有限責任公司的設立條件和程序。《公司法》第二十三條規定，設立有限責任公司應當符合五個條件。股東符合主體、人數等法定要求；股東出資達到法定資本最低限額；制定公司章程；有公司名稱並建立符合國有獨資有限責任公司要求的組織機構；有固定的生產經營場所和必要的生產經營條件。
國有控股公司:
國家控股公司應當是國家以自主投資設立，經國務院批準，在授權範圍內對國有資產行使所有者權利，以持股為主從事資產經營活動，並依法登記註冊的特殊企業法人。這類公司不允許宣布破產。公司清算時，凈資產不足清償債務的，不足部分由國務院承擔。
主營業務應符合國家產業政策，行業應在國民經濟中占有非常重要的地位；其凈資產和總資產應達到壹定規模。報批文件上要有明確的要求和規定，包括章程、業務範圍等。公司的法人治理結構也不同於壹般公司。可以實行總經理負責制，成立黨組，向國務院派出監事會。
3.不同的管理系統
國有獨資公司:
國有獨資企業由政府出資，隸屬於政府，由政府任命或選舉並經政府批準的廠長(經理)負責，註重隸屬關系；國有獨資公司以產權清晰、權責明確、保護嚴格、流轉順暢的現代產權制度為指導，建立以資產為紐帶的清晰的現代國有產權管理制度。
國有控股公司:
國有控股公司的企業制度除具備壹般現代企業制度的所有特征外，還應符合以下基本原則:維護股東權益，有利於國家控股；改善和加強黨的領導；效率優先，兼顧公平，實行以按勞分配為主體的多種分配形式；強化職工主人翁地位，普遍參與民主管理。
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