會員制證券交易所是不以營利為目的的交易所，會員自主、自律、相互約束，參與經營的會員可以參與股票交易和交割。目前，世界上許多著名的證券交易所都采用會員制證券交易所的形式。
公司證券交易所是證券交易所的壹種組織形式。由投資者組織的具有股份有限公司性質的證券交易所。這種證券交易所只提供場地、設備、人員等。在政府主管機構的管理和監督下，吸收各類證券公司在集中交易市場自由買賣，進行集中交割。
收取發行公司“上市費”，提取證券交易“手續費”，但不參與本所上市證券的交易。這種以公司為基礎的交易所，自負盈虧，實際上是壹個以盈利為目的的私人公司。
2.不同的特點
證券交易所的特點是，證券交易所的決策機構是會員大會(股東大會)和董事會(董事會)。其中，會員大會是最高權力機構，決定證券交易所的基本政策；理事會是壹個協議機構，由主席和若幹董事組成。它制定實施會員大會決定的基本原則所必需的具體方法，並制定各種規章制度。
證券公司的特點是大部分是國有控股企業，資產的贈與必須符合國有資產管理部門的相關規定；大部分是未上市公司，股份流通受限，沒有市場價格，但有上市計劃，能滿足上市公司相關規定。因此，股票期權和員工持股更適合我國證券公司。
3.不同的責任
證券交易所應當為公平集中交易的組織提供保障，公布證券交易的實時報價，並按照交易日編制證券市場報價清單並予以公布。
證券公司的主要職責是設計和策劃改制企業的股票上市，其主要任務包括:參與企業改制方案的設計和制定，為擬發行股票的改制企業提供上市指導，起草、匯總和提交發行上市的全部申請材料。
參考資料:
百度百科-公司股票交易所
百度百科-會員制證券交易所