第壹，目標導向和盈利性
業務部門的核心目標是盈利。他們通過銷售商品和提供服務獲得收入，從而實現經濟利潤最大化。這些單位通常需要在市場競爭中尋求生存和發展，因此其經營管理更註重經濟效益。
相比之下，非經營性單位不以盈利為主要目標。他們更加註重社會福利、科學研究、文化教育的發展，旨在為社會提供更多的服務和支持。這些單位通常由政府、慈善機構、社會組織等建立和管理。，其資金來源主要是政府撥款和社會捐贈。
二、運營管理及責任
經營單位在經營過程中需要遵守市場規則，接受市場競爭的考驗。他們需要制定有效的商業策略來提高生產效率和服務質量，以贏得市場份額和客戶信任。同時，經營單位也需要承擔經營風險，對自己的經營行為負責。
非經營性單位更註重社會效益的實現和公共責任的承擔。在經營過程中，他們需要遵守相關的法律法規和社會道德規範，以保證其活動的合法性和公平性。同時，非經營性單位也需要積極履行社會責任，為社會做出積極貢獻。
第三，組織結構和決策機制
業務部門通常采用更靈活的組織結構來適應市場競爭和客戶需求的變化。在決策機制上，業務部門更加註重市場導向和經濟效益評估，以保證決策的科學性和有效性。
非運營單位可以采用更加穩定的組織結構，以保證其活動的連續性和穩定性。在決策機制上，非運營單位通常需要更加註重社會效益的評估和公共利益的平衡，以保證決策的合理性和公平性。
總而言之:
運營單位與非運營單位在目標導向、盈利性質、運營管理、責任承擔、組織結構、決策機制等方面存在顯著差異。這些差異使得它們在運作方式、活動領域、社會功能等方面具有不同的特點和優勢。
法律依據:
中華人民共和國公司法
第12條規定:
公司的經營範圍由公司章程規定，並依法登記。公司可以修改公司章程，變更經營範圍，但應當辦理變更登記。
公司經營範圍中法律、行政法規規定須經批準的項目，應當依法經過批準。
中華人民共和國民法典
第87條規定:
非營利法人包括事業單位、社會團體、基金會和社會服務機構。非營利法人不得向其投資者、創始人或成員分配利潤。但是，法律另有規定的除外。