2000年3月，根據中國石油化工集團公司改制上市戰略規劃，原九江石化總廠壹分為二，主營業務全部劃歸中國石油化工股份有限公司，成立中國石油化工股份有限公司九江分公司。非主營業務部分保留中國石化集團九江石化總廠名稱，形成總廠與分公司(簡稱合並為九江石化)並存的新體制。
2007年，根據中國石油化工集團公司總體改革安排，九江石化總廠將於9月20日前完成總廠改制，組建中國石油化工集團資產經營有限公司九江分公司，撤銷中國石油化工集團九江石化總廠。中國石化集團資產經營有限公司九江分公司於5月22日在工商註冊成立。
投產27年來，企業不斷發展壯大，已從單壹的煉油型成功轉型為集煉油、化工、化肥為壹體的石化聯合企業。1980建成壹系列煉油；1997年，我們開始了“二次創業”，先後建成投產了第二套常減壓蒸餾裝置、第二套催化裝置、16萬噸/年氣體分離裝置、52萬噸/年尿素裝置、30萬噸/年氨合成裝置和7萬噸/年聚丙烯(2003年擴建至65438+10萬噸/年) 這為九江石化進壹步提高原油深加工能力、保證產品質量、促進環境保護邁出了堅實的壹步。 截至2007年6月，九江石化已完成總煉油能力5497萬噸，生產化肥458.82萬噸，聚丙烯86543.80+0.44萬噸，實現利稅6543.80多億元。企業管理逐步與國際接軌，建立並運行了HSE、計量、質量管理體系，實施了內部控制制度。該標準體系已獲得最高國家4A認證。