1999，5月19行情時，南方證券啟動虹橋機場，用中關村科技換下瓊民源；
2000年，南方證券承銷業務位居全國第壹，主承銷股票37只，募集資金總額2065438+億元，各項主要業務指標均為行業第壹。經紀業務也躍升至行業第三；總資產達到368.2億元，利潤達到1169萬元。
2001，南方證券完成了春蘭股份的增發，這個項目被業內認為是其代表作。同年2月25日，南方證券在剝離早年積累的大量不成功的實業投資後，宣布增資擴股成功。註冊資本由6543.8+0億元增加到34.5億元。老股東將截至2000年6月30日的凈資產654.38+0.665億元全部轉為新設立的股份公司，並溢價發行新股，發行價格為每股654.38+0。
2001年初，南方證券重點發展委托理財業務。2001南方證券第壹大股東上海汽車與南方證券簽訂4億委托理財合同。
2002年，南方證券與華德資產簽訂了3億委托理財合同。華德資產管理公司是南方證券的全資公司，成立於2001年7月，註冊資本3億元，註冊地為上海。
2003年8月，南方證券在中國銀行間同業拆借市場公布了其2001和2002年度未經審計的資產負債表。2000年南方證券委托資產為26.22億元，2006年5438+0年為45.92億元，2002年為31.51億元。但按照目前證券公司的財務制度，證券公司代客理財屬於表外業務，證券公司完全可以把委托理財業務放到表外。因此，南方證券的委托理財真實規模壹直未被市場明確。
2003年6月5438+10月，南方證券爆發大規模信用危機，委托理財客戶紛紛前來索要投資本金和收益。南方證券的生死懸於壹線。當時南證的客戶保證金存款在80億元左右，委托理財規模也在80億元左右。
2004年6月2日，因挪用客戶備付金高達80億元，自營業務巨額虧損，中國證監會和深圳市政府宣布對南方證券股份有限公司進行行政接管。
2005年2月，央行提供了80億元的再融資，幫助南方證券支付保證金。
2005年4月29日，南方證券進入清算階段，其券商投行業務剝離獨立運營，整體打包競價重組。