需要支付的稅款有:
1，企業所得稅
按照搬遷方案，企業恢復原生產經營或異地重建後轉為新的生產經營，購建與搬遷前性質和用途相同或相似的新的固定資產和土地使用權(以下簡稱置換固定資產)，或改良其他固定資產，或進行技術改造，或安置職工， 其搬遷或處置收入扣除固定資產更新或改良、技術改造和職工安置費用後的余額，應計入企業應納稅所得額。
2.印花稅
由於印花稅是以掛牌方式征收，而《拆遷補償協議》並未掛牌，因此這筆拆遷補償收入也可以暫免征收印花稅。
3.土地增值稅
《土地增值稅條例》第八條規定，因國家建設需要依法征用、收回的房地產，免征土地增值稅。《土地增值稅暫行條例實施細則》第十壹條規定，條例第八條第二項所稱因國家建設需要依法征用、收回的房地產，是指因城市規劃和國家建設需要，由政府征用或者收回的房地產。
壹、企業主遇到拆遷糾紛應該如何維護自己的合法權益？
首先，明白自己應該得到的補償。壹般來說，企業拆遷補償主要分為以下四個方面:
1.企業自身拆遷的補償費用，包括:土地、建築物和地上附著物的補償，以及因搬遷而損失的機器設備；
2、停產停業損失，視實際情況而定，壹般來說是企業在拆遷過程中的實際經營損失；
3.拆遷補償，包括搬遷過程中的費用、停工費用、機械設備修理費用和運輸費用；
4.基於拆遷政策的獎勵費，包括快速搬遷費和拆遷獎勵費。
綜上所述，比如企業搬遷資金和個人搬遷資金其實不在征稅範圍內，稅務局對搬遷資金有免稅政策支持。
法律依據:
《中華人民共和國土地管理法》第四十八條
征用農用地、地上附著物和青苗以外的土地的補償標準，由省、自治區、直轄市制定。按照先補償後搬遷、改善居住條件的原則，對農村村民房屋進行公平合理補償，尊重農村村民意願，通過重新安排宅基地建房、提供安置房或貨幣補償等方式給予公平合理補償，並對因征收引起的搬遷和臨時安置費用給予補償，保障農村村民的居住權和合法的房屋財產權益。