獨立運行模式。所謂獨立運行模式，是指創業板市場有獨立於主板市場的交易系統、監管系統和上市標準，完全是另壹個市場。美國的納斯達克、歐洲的EASDAQ、日本的JASDAQ以及中國臺灣地區的OTC市場都采用了這種模式。比如成立於1971的納斯達克市場，在與主板市場的競爭中發展壯大。截至2月底，納斯達克共有4800多家上市公司，市值超過5.2萬億美元。此外，在美國所有高科技公司中，94%的軟件、87%的生物醫藥、81.9%的電子元器件、88.8%的計算機及外圍設備、86.8%的通信設備都在納斯達克上市。
附屬市場模式。這種模式意味著創業板依附於主板市場，與主板市場擁有相同的交易制度、監管標準和監管團隊，唯壹不同的是上市標準。英國的AIM、新加坡的SSEDAQ和香港的創業板都采用了這種模式。如果香港創業板是港交所在主市場之外設立的附屬市場，兩個市場都是由港交所經營，運作程序相同。但兩個市場之間缺乏競爭關系，尤其是科技企業擴張後可能會轉移到主板市場，影響創業板市場的發展。例如，香港創業板首批上市公司之壹的浩倫農業科技集團正在申請其股票在主板市場上市。
新的市場模式。該市場由小盤股市場現有的幾個交易系統組合而成，其會員市場符合最低運行標準，具備實時行情，並相互承認會員資格。典型的例子就是歐洲的Euro-nm市場，成立於1996 March 1。它是壹個專門為高增長公司設計的股票市場網絡，由五個新的股票市場組成，包括法國、荷蘭、德國、比利時和瑞士。截止1998年末，上市公司165家，市值369億美元。新歐洲市場的目的是建立壹個完全統壹的泛歐洲高增長股票市場網絡，網絡上的任何壹點都可以獲取全歐洲的信息，實現交易。其中德國新市場由法蘭克福證券交易所於3月1997成立，是歐洲二板市場中最成功的市場。到4月1999，市值超過400億美元的上市公司有80家。