1.物理方法:
水綿的繁殖方式為斷裂繁殖，即細絲因機械損傷或其他原因斷裂成若幹短絲，每根短絲通過細胞分裂長成細絲。即物理捕撈會加速水綿的生長繁殖，導致捕撈更多。
2.化學方法:
目前常用的化學藥劑主要有硫酸銅、高錳酸鹽、硫酸鋁、高鐵酸鹽復合劑、液氯、ClO2、O3？而H2O2呢？等等。使用化學藥品無疑是壹種有效的方式，效果明顯且見效快，但這只是壹種治標的方法，必須謹慎使用。壹是化學藥劑本身往往具有毒副作用，造成二次汙染，對水體生物影響較大，使用化學藥劑後的河道不利於生物恢復；第二，使用化學藥品只能在短時間內控制水中的水綿。因為不能完全殺死，所以過不了多久又會死灰復燃，有時甚至會變本加厲，對於水來說會是壹個惡性循環。可以說，用化學方法治理河流是“飲鴆止渴”。這個國家已經限制在河流治理中使用化學方法。
3.生物方法:
水綿的生物處理原理；
使用Eama-11水綿生物除藻劑快速抑制水綿的生長和繁殖。由從自然環境中篩選出的對水綿生長有抑制作用的微生物馴化培養而成。它易溶於水，並能迅速擴散到水綿細胞表面，滲透到細胞內部破壞細胞的功能蛋白質組，使細胞的蛋白質合成受到抑制，終止細胞的正常代謝，最終控制水綿的生長。
特點1-高效抑藻
具有較強的抑制水綿生長的能力，該生物制劑對水綿已暴發的水體中的水綿有90%以上的抑制作用。
特點2-簡單的施工和現場處理
邦元環保的生物河道處理工藝使用的設備簡單，不需要大量人力打撈水綿，即水綿不需要轉出水面就可以在水中消化。因此，施工方便，操作簡單，不產生噪音，不影響周圍居民的正常生活。
特點三——產品綠色環保無汙染。
①生物制品不燃、不揮發、綠色、安全、無毒、無二次汙染。
②兼容性好。由於該抑制劑無毒副作用，可與其他生物制劑聯合使用，具有協同作用。
③生物降解性優異。抑制劑抑制水中水綿生長後，不會有殘留。
4.生物生態修復技術
生態生物法是近年來發展起來的壹種新的環境生物技術。這類技術主要是利用微生物、植物等生物的生命活動，轉移、轉化、降解水中的汙染物，從而凈化水質，創造適合多種生物生存繁衍的環境，重建和恢復水生生態系統。因為這種技術具有處理效果好、工程造價相對較低、無或低能耗、運行費用低等優點。同時，沒有任何化學物質投入水體，不會造成二次汙染。也可與綠化環境、景觀改善相結合，創造人與自然融為壹體的優美環境。因此，它已成為水汙染和富營養化控制的主要發展方向。
生態生物修復技術包括:微生態系統修復技術、人工濕地技術、浮島技術、植物控制技術、生態護岸技術、生態復氧技術、生態疏浚技術、水生動物恢復與重建技術等。在實際工程應用中，可根據水汙染程度、水環境現狀和水體功能選擇不同的技術組合，從而呈現生態效益和經濟效益雙贏的局面。
北京邦元環保科技有限公司利用生物方法和生物生態修復技術，在北京、江蘇、山東、海南、河北、雲南等地完成了數十個水體生物修復項目，具有豐富的管理經驗。可提供系統整體解決方案，陽光24小時跟蹤服務機制。
因為內河治理的最終目的是恢復河流生態系統的功能和結構，促進系統的自我維護和自我發展。因此，邦元環保應用的生物生態修復技術被認為是21世紀中國生態環保領域最具價值和生命力的生物治理技術。