1，不同的隸屬關系。國務院所屬企業是指由國務院直接管理或其他部門授權的企業，如中央金融企業、中央行政事業單位所屬企業等。SASAC所屬企業是指由SASAC直接管理或其他機構授權的企業，如中央企業和兩類公司。
2.不同的監督職能。國務院所屬企業主要由財政部門或其他相關部門監管，重點是預算、稅收征收和政策執行。隸屬於SASAC的企業主要由SASAC或其下屬機構監管，重點是資本運作、效益考核、改革創新。