司法部的職能機構
辦公廳、政治部、監獄管理局、戒毒管理局、社區矯正管理局、法制宣傳處、律師公證指導處、法律援助處、基層工作指導處、國家司法考試處、司法鑒定管理局、法律事務處、司法救助外事處、財務裝備處、機關黨委和離退休幹部局。
直屬單位
司法部信息中心、司法研究所(研究室)、辦公服務中心、鹽城監獄、法律援助中心、部直屬煤礦管理局、預防犯罪研究所、法制日報社、法律出版社、中華全國律師協會、中國公證協會、中國監獄工作協會、中國司法行政戒毒協會、中央司法警官學院、司法行政學院、國家司法考試中心、中國法律援助基金會、司法協助交流中心、司法鑒定科學技術研究所、 中國法律服務(香港)有限公司、中國法律服務(澳門)公司、司法部港澳臺法律培訓交流中心(籌)。
常駐組織
駐部紀檢組監察局。
根據《國務院辦公廳關於印發司法部主要職責內設機構和人員編制規定的通知》(國辦發〔2008〕64號)，司法部主要承擔以下職能:
(壹)擬訂司法行政工作的方針政策，起草有關法律法規，制定部門規章，制定司法行政工作發展規劃並組織實施；
(二)負責管理全國監獄並承擔相應責任，監督管理刑罰執行和罪犯改造工作；
(三)負責指導和監督司法行政系統戒毒場所的管理工作；
(四)擬定全民普法規劃並組織實施，指導各地、各行業的法制宣傳、依法治理和對外法制宣傳；
(五)負責指導和監督律師和公證工作，並承擔相應責任，負責港澳律師作為委托公證員的委托和管理；
(六)監督管理全國的法律援助工作；
(七)指導和監督基層司法所建設和人民調解、社區矯正、基層法律服務和幫教工作；
(八)組織實施國家司法考試；
(九)負責全國司法鑒定人和司法鑒定機構的登記管理工作；
(十)參與有關國際司法協助條約的起草和談判，履行司法協助條約規定的中央機關的相關職責；
(十壹)指導司法行政系統的對外交流與合作，組織和參與聯合國預防犯罪組織與刑事司法領域的交流活動，承辦涉港澳臺司法行政事務；
(十二)負責司法行政系統槍支、彈藥、服裝和警車的管理，指導和監督司法行政系統的財務規劃；
(十三)指導和監督司法行政隊伍建設和思想作風、工作作風建設，負責司法行政系統的警務管理和警務監督，協助省、自治區、直轄市司法廳(局)領導幹部管理工作；
(十四)承辦國務院交辦的其他工作。