壹、公司虛開發票被查處立案後如何處理？
如果公司虛開發票構成犯罪，經濟犯罪偵查大隊將立案偵查，偵查結束後收集相關證據，再移送檢察院決定是否起訴。
公安機關辦理刑事案件程序規定
第壹百七十八條公安機關受理案件後，經過審查，認為有需要追究刑事責任的犯罪事實，屬於自己管轄的，經縣級以上公安機關負責人批準，予以立案；認為沒有犯罪事實，或者犯罪事實明顯輕微不需要追究刑事責任，或者有其他依法不追究刑事責任情形的，經縣級以上公安機關負責人批準，不予立案。
有申訴人的案件決定不立案的，公安機關應當制作不立案通知書，並在三日內送達申訴人。
決定不立案後發現新的事實或者證據，或者發現原有事實有錯誤，需要追究刑事責任的，應當及時立案。
第壹百九十壹條公安機關對已經立案的刑事案件，應當及時偵查，全面、客觀地收集、調取犯罪嫌疑人有罪或者無罪、罪輕或者罪重的證據。
第二百八十九條偵查終結的案件，應當提出起訴意見，經縣級以上公安機關負責人批準後，連同全部案卷材料、證據和辯護律師提出的意見，移送同級人民檢察院審查決定。同時告知犯罪嫌疑人及其辯護律師案件移送情況。
犯罪嫌疑人自願認罪的，應當記錄在案，隨案移送，並在起訴意見中載明相關情況；認為案件符合速裁程序適用條件的，可以向人民檢察院提出適用速裁程序的建議。
二、如何界定虛開發票
貨物交易或服務發生時，只要出票人不是實際的賣方(提供方)；或者出票人為實際賣方(供應商)，但金額與實際交易項目不符，與實際經營情況不符，即構成虛假陳述。
(1)虛開發票包括:
1.為他人和自己開具與實際經營情況不符的發票。
2.讓他人為自己開具與實際經營情況不符的發票。
3.介紹他人開具與實際經營情況不符的發票。
通過以上分析我們知道，根據《公安機關辦理刑事案件程序》的規定，公安機關經濟犯罪偵查部門對虛開發票案件立案後，會收集相關證據，偵查結束後會移送檢察院，由檢察院決定是否起訴。