1，未按照規定保存資料，造成會計資料毀損、滅失的，由縣級以上人民政府財政部門責令限期改正，並可對單位處以3000元以上5萬元以下的罰款；
2.對直接負責的主管人員和其他直接責任人員可以處以2000元以上2萬元以下的罰款。屬於國家工作人員的，還應當由其所在單位或者有關單位依法給予行政處分；
3、會計人員有上述行為，情節嚴重的，由縣級以上人民政府財政部門吊銷會計從業資格證書；
4.上述行為構成犯罪的，依法追究刑事責任。
會計、出納和移交原始憑證所需的程序如下:
1.已受理的經濟業務未填制記賬憑證的，應當填制記賬憑證；
2.未登記的賬戶應當登記，並制作余額表，在最後壹筆余額後加蓋經辦人印章；
3、整理好所有應移交的資料，並對未了事項和遺留問題寫出書面說明；
4.編制交接清單，列出應移交的會計憑證、會計賬簿、財務會計報告、公章、現金、有價證券、支票簿、發票、單據、其他會計資料和物品。實行會計電算化的單位，從事此項工作的交接人員應在交接清單中列出會計軟件及密碼、會計軟件數據磁盤、磁帶等內容；
5.會計機構負責人(會計主管人員)交接時，應向交接人員清楚介紹財務會計工作、重大財務收支事項和會計人員情況。
歸納起來，會計憑證丟失的責任有:會計人員未按規定保管會計資料，造成會計資料毀損、滅失，情節嚴重的，由縣級以上人民政府財政部門吊銷會計從業資格證書；構成犯罪的，依法追究刑事責任。
法律依據:
《中華人民共和國會計法》第四十二條
違反本法規定，有下列行為之壹的，由縣級以上人民政府財政部門責令限期改正，可以並處三千元以上五萬元以下的罰款；對直接負責的主管人員和其他直接責任人員可以處以2000元以上2萬元以下的罰款；屬於國家工作人員的，還應當由其所在單位或者有關單位依法給予行政處分:
(壹)未依法設置會計賬簿的；
(二)私自設置會計賬簿的；
(三)未按照規定填制或者取得原始憑證，或者填制或者取得的原始憑證不符合規定的；
(四)依據未經審核的會計憑證登記會計賬簿或者登記會計賬簿不符合規定的；
(五)擅自改變會計處理方法；
(六)向不同會計資料使用者提供的財務會計報告的編制依據不壹致；
(七)未按照規定使用書面會計記錄或者記賬本位幣的；
(八)未按照規定保管會計資料，造成會計資料損毀或者丟失的；
(九)未按照規定建立和執行單位內部會計監督制度，或者拒絕依法進行監督或者未如實提供有關會計信息和相關資料的；
(十)會計人員的任用不符合本法規定的。
有前款所列行為之壹，構成犯罪的，依法追究刑事責任。
會計人員有第壹款所列行為之壹，情節嚴重的，五年內不得從事會計工作。
有關法律對第壹款所列行為的處罰另有規定的，依照有關法律的規定辦理。