2007年底，她聽說院裏要進行中層幹部調整，她很想通過競爭重新回到公訴處。她回到家裏與丈夫商量，壹向支持她工作的丈夫卻在此時與她唱起了反調。雖然丈夫百般不願，但她依然通過競爭走馬上任，擔任公訴二處副處長，主持工作，準備大幹壹番。公訴二處人員沒有增加，案件數量卻持續上升;全處人員知識水平高、學歷高，但年輕人多、經驗不足;案件辦理難度大、質量要求高，但昌平院公訴工作成績並不理想。如何帶好隊伍、提高案件辦理質量、取得公訴考核優秀成績，是她需要迫切解決的問題，她把目光放在了訴訟監督這壹檢察機關的重要職能上。 她著重在制度建設上下功夫，先後組織制定了《公訴部門關於加強刑事抗訴工作的實施辦法》、《公訴部門業務考核辦法》、《被告人上訴案件審查統計工作實施細則》等規章制度，極大地提高了審判監督的效果。 “有錯必糾我不怕得罪人。”彭燕有壹個習慣，交給她分案的案件她不是只看起訴意見書，而是要把預審卷宗調過來看，這壹看就看出了問題，秦健翔盜竊案就是壹個例證。 在預審卷宗中，彭燕發現秦健翔在之前的供述中壹直對其盜竊罪予以否認，只有2007年11月3日這份筆錄承認他盜竊的事實。但同時，彭燕發現了問題:公安局派出所民警填寫的訊問時間是2007年11月3日，而犯罪嫌疑人填寫的是2007年11月2日，並且秦健翔在筆錄尾部填寫了“以上記錄和我說的壹樣”，但漏填“以上記錄我看過”。彭燕意識到了問題的嚴重性，提醒承辦人提訊時壹定要攻下口供，否則案件難以繼續進行。案件最終順利起訴，彭燕懸著的心終於放下了。 案件終結後，彭燕要求承辦人給公安機關發了壹份檢察建議，公安機關給予高度重視，全面整改，給予扣發責任人獎金等處罰，監督效果良好。 之後，她想到應該把這種偵查監督的意識落實到每個承辦人的具體工作中，在研究分析刑事訴訟法、人民檢察院刑事訴訟規則、公安機關辦理刑事案件程序規定、預審工作規則、公安機關執法質量考核評議規定等規定的基礎上，她想到制定壹個《刑事偵查監督工作實施細則》，把公安偵查活動每個環節應審查的具體事項明確列舉出來，承辦人拿到壹個案子，就會明確每項偵查活動可能出現的問題、應該註意的細節等，增強整體訴訟監督的實效。
1997年，彭燕畢業於中國政法大學，畢業後進入北京市昌平區檢察院，28歲開始擔任主訴檢察官，2002年開始帶領三名承辦人全面負責未成年人工作，至今已十二年，並擔任昌平區檢察院專門設立的未成年人刑事案件檢察處處長壹職。
談起青少年犯罪與對未成年的權利保護，彭燕曾經辦理的壹起大學生盜竊案件。案件中的這名大學生來自偏遠山村，父母都是農民，家裏供養他上學十分不易。對於父母的含辛茹苦，他看在眼裏疼在心裏。在校期間，他想盡辦法節省開支，還時常通過做兼職補貼家用。某年暑假實習時，與他同住的壹名同學將錢包放在房間，裏面大約有2000元錢。彭燕說，“當時他看到錢的第壹反應就是，拿走這些錢就不用再擔心下學期的學費問題了。”在這種想法的支配下，這名大學生最終忍不住拿走了這些錢。結果案發了。“當時北京市關於盜竊罪的最低定罪標準是1000元人民幣。因此，他被刑拘、移送審查起訴。”說到這裏，彭燕的語氣還是略微地透露出當時的擔心與緊張。因為她深知，被起訴對於壹個剛剛才開啟美好人生的孩子來說，將是壹輩子不可磨滅的“標簽”；而對於壹個將全部希望都寄托在孩子身上的窮苦家庭來說，更意味著難以承受的重挫。因此，在充分理解中國刑事司法政策的基礎上，配合壹些相關的輔助工作，彭燕通過到看守所提訊嫌疑人，了解了他的犯罪動機、整個犯罪實施過程與成長背景、在校生活學習情況。她意識到這只是壹名由於壹時沖動、偶然走上犯罪道路的青少年。社會給予他的應該是挽救、保護和教誨，而不是懲罰。正是本著這樣的理念，彭燕及相關的辦案人員在進行相關論證、匯報之後，最終對這名大學生作出了不起訴的決定，並且與他所在的學校取得聯系，讓他重新返回了校園。 2011年2月，北京市昌平區人民檢察院與偵查機關配合挖出了壹個被害人遍布全國、詐騙數額特別巨大的犯罪團夥。該團夥26名犯罪嫌疑人冒充電視購物公司員工，以電話、短信等方式和贈送勞力士表、汽車加油卡等為幌子進行詐騙。
該案犯罪嫌疑人多，卷宗多，被害人多，案件復雜。公訴二處要在3天之內完成對5000多名被害人的告知工作，審查大量書證、物證和電子證據，完成對每壹起犯罪事實及犯罪數額的認定，困難程度可想而知。
彭燕與承辦人反復討論案件細節，指導承辦人對涉案賬本、快遞發貨清單、嫌疑人工作記錄、被害人陳述等證據進行仔細梳理、核算，按時完成對所有犯罪嫌疑人的提訊，認真核對每壹起犯罪事實。最終，該案被成功起訴到法院，經過他們認真細致的工作，涉案金額由最初公安機關移送審查的9萬余元追加到350余萬元，主犯仝某被判處有期徒刑十三年。 彭燕辦案有壹個習慣，對每個案件不僅要看起訴意見書，還要把預審卷宗調過來細看，為此付出了許多個人時間。
這壹看還真讓她看出問題。有壹起重婚案，偵查機關在不符合刑事訴訟法規定的“流竄作案、多次作案、結夥作案”的情況下，將拘留期限延長至30日。案件終結後，彭燕給該偵查機關發出糾正違法通知書，對方進行了全面整改。
看預審卷宗無疑增加了極大工作量。為此，彭燕每天提前兩小時到單位，推遲壹小時下班，如今算起來，她已累計加班1800多個小時。
要做到公正執法就要自身正、自身硬、自身凈。彭燕辦案堅持原則，凡為案件說情的、送禮的、送錢的或者請吃飯的都被她婉言拒絕。有位當事人親屬多次找彭燕送禮被拒後仍不死心，反復打電話表示匯款並問她的銀行賬號，經彭燕壹番耐心細致的思想教育後，對方放棄了此做法。
把公正意識變成工作制度。彭燕認為應該把偵查監督意識落實到每個承辦人具體工作中，形成長效機制。她在研究現有制度基礎上，領銜制定出《刑事偵查監督工作實施細則》，把偵查機關偵查活動每個環節應審查的具體事項明列出來，承辦人拿到案子就會明確每項偵查活動可能出現的問題，應該註意的細節等，確保了訴訟監督的實效。 彭燕的先進事跡經新聞媒體報道後，人民群眾來信來電多起來。不少人找她尋求法律援助，彭燕積極幫助群眾排憂解難，從不推托。
“活著沒有意義……”2010年3月，壹封署名小雲的來信引起了彭燕的註意。叫小雲的女孩在信中訴說了自己兩次失敗的婚姻和屢遭家庭暴力的遭遇，字裏行間流露出悲觀厭世的情緒，信紙上還有淚痕。彭燕看後認為人命關天，必須馬上解決。
彭燕立即打電話與小雲取得了聯系。電話那頭的小雲驚喜之後開始泣不成聲。彭燕用自己的親身經歷鼓舞小雲，告訴她要快樂生活、快樂工作、永不放棄，建議她通過法律途徑維護自己的合法權益……兩個小時過去了，小雲的情緒慢慢平復下來。
接下來的幾天，遠在廣州的小雲成了彭燕心中最大的牽掛，她記不清給小雲打了多少次電話，記不清說了多少句話。經彭燕反復做思想工作，小雲逐漸從絕望中走了出來，現在的她不僅有了對生活的勇氣和信心，而且還找到了壹份滿意的工作。
為了加強與群眾的溝通聯絡，了解群眾訴求，更好地發揮檢察職能，北京昌平區檢察院不久前面向社會開通了“彭燕熱線”和“彭燕郵箱”，架起了檢察機關溝通人民群眾的“連心橋”。 彭燕還註重創新，她針對近年來流動人口犯罪現象日趨增多，外地未成年人父母由於時間、經濟等方面原因不能參與訊問的問題，考慮由法律援助律師作為“臨時父母”維護未成年人合法權益。不久前，昌平檢院推出《合適成年人制度》，這項制度最大亮點是為未成年犯罪嫌疑人權益保護提供了新載體，提升了檢察機關公信力，同時也創新了少年刑事司法制度。
三年來，彭燕先後審查決定或審查備案案件984件1353人，接到群眾來信29封、來電78次、來訪16次，開展釋法說理27次，推出創新機制9項，公開發表調研文章8篇。 2010年2月10日是農歷臘月廿七，北京昌平檢院門前傳來壹陣鑼鼓聲，群眾舉著壹面鮮紅錦旗走向檢察院，“公正廉明、執法如山、法眼如炬、明察秋毫”幾個大字在陽光下格外耀眼，這些群眾是專程前來感謝公訴二處檢察官的。
事情緣於壹起故意傷害案。16歲的劉某將黃某打成重傷，雙方情緒激動、對立嚴重。彭燕與同事劉文華壹起積極做當事人的工作，促使劉某在法定賠償數額的基礎上積極賠償黃某的精神損失，最終雙方達成了和解，法院也據此對黃某予以從輕處罰，從而化解了壹起社會矛盾。
在彭燕的帶領下，公訴二處相繼獲得“北京市未成年人保護先進集體”、“優秀青少年維權崗”等榮譽稱號。