解決特許經營合同糾紛的方式有三種:第壹種是調解，雙方當事人在尊重雙方利益的基礎上，通過協商就爭議事項達成和解協議，從而解決糾紛。二是調解。在人民調解委員會的主持下，雙方通過說服教育解決當事人之間的合同糾紛。雙方接受調解並達成協議的，可以向人民法院申請制作調解書，調解書與法院生效判決具有同等效力。三是仲裁和訴訟。爭議發生後，雙方不能達成和解或者調解的，可以根據仲裁協議提起仲裁，也可以直接向人民法院提起訴訟。需要註意的是，特許經營合同糾紛壹般是特許經營合同糾紛，訴訟的壹審法院是中級人民法院。
法律依據:《民事訴訟法》第二十三條規定:因合同糾紛提起的訴訟，由被告住所地或者合同履行地人民法院管轄。
第三十四條。合同或者其他財產權益糾紛的當事人可以通過書面協議選擇被告住所地、合同履行地、合同簽訂地、原告住所地、標的物所在地等與糾紛有實際關系的地點的人民法院，但不得違反本法關於級別管轄和專屬管轄的規定。
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