旗艦店:壹般來說，旗艦店只賣自己的品牌，只賣壹個品牌，不賣其他無關的品牌。
加盟店:加盟店是品牌的加盟，而不是公司本身的加盟。已經授權給他的品牌，如耐克、阿迪達斯等，都有網上銷售的授權。
加盟店:他們可以經營自己的品牌和其他品牌，只做壹種商品，比如鞋子，但可以做多個品牌，比如加盟鞋店、耐克鞋、阿迪達斯鞋甚至其他品牌。品牌數量不限。
2.不同的商業實體:
旗艦店:品多多旗艦店是私人品牌企業，也就是說，品多多旗艦店經營的品牌必須是申請品多多店鋪的企業或企業法人代表所有。
店鋪:拼多多店鋪的經營者必須是品牌所有人或公司正式授權的企業法人。
加盟店:拼多多店必須由在中國大陸註冊的法人實體經營。
3.不同的品牌資質:
旗艦店:旗艦店必須有國家商標局頒發的商標註冊證或商標受理通知書，即註冊商標。
店鋪:壹個品牌店鋪需要兩樣東西，壹是國家商標局出具的有商標註冊證的品牌所有人(即上述註冊商標的品牌旗艦店)，二是正式授權函出具的品牌所有人開店。品牌所有人為個人的，需提供身份證復印件，並簽署授權委托書。
加盟店:經營其他品牌，需提供完整的品牌所有人授權書和商標註冊證；如果商家不能提供層層品牌授權，也可以提供供應商出具的官方渠道證明和品牌商的商標註冊證明。
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