1、商標被別人申請撤三的處理如下：
（1）如果商標確實沒有用，也不打算要了，可以放棄答辯，該商標自然會被撤銷掉；
（2）如果商標確實有使用，要積極應對，委托代理人或者律師組織答辯，提交有效的使用證據，維持商標註冊；
（3）重新提交壹件商標註冊申請，爭取新的註冊機會；
（4）和撤銷申請人或者其代理聯系，了解撤銷原因，爭取通過談判讓對方撤回“撤三”申請。
2、法律依據：《中華人民***和國商標法》第四十九條
商標註冊人在使用註冊商標的過程中，自行改變註冊商標、註冊人名義、地址或者其他註冊事項的，由地方工商行政管理部門責令限期改正；期滿不改正的，由商標局撤銷其註冊商標。
註冊商標成為其核定使用的商品的通用名稱或者沒有正當理由連續三年不使用的，任何單位或者個人可以向商標局申請撤銷該註冊商標。商標局應當自收到申請之日起九個月內做出決定。有特殊情況需要延長的，經國務院工商行政管理部門批準，可以延長三個月。
第五十條
註冊商標被撤銷、被宣告無效或者期滿不再續展的，自撤銷、宣告無效或者註銷之日起壹年內，商標局對與該商標相同或者近似的商標註冊申請，不予核準。
二、哪些是商標的有效使用證據呢
1、近三年來的宣傳資料，包括報紙、雜誌、公司的宣傳手冊等；
2、銷售合同和發票、加盟許可合同等等，必須要明確商標名稱；
3、近三年的銷售範圍、銷售發票復印件或者是銷售額說明等；
4、近三年來相關媒體對該企業的報道和采訪資料等；
5、帶有商標標樣的產品質檢報告等。