(1)原因不同:
商標被駁回是因為申請註冊的商標不符合“在先申請或註冊”原則，違反了禁止性規定，商標局駁回了商標註冊申請。
因申請人提交的商標申請文件不齊全或者不符合有關規定，商標申請不予受理。
(二)審查對象不同
商標被駁回是因為不符合核準註冊的條件，所以審查的對象只能是商標本身。
商標申請不受理主要是因為申請材料有問題，只屬於形式審查階段，審查的對象也只是商標申請文件和商標表格。
(3)出具的文件不同
商標局收到商標註冊申請後，主要發出三種通知:受理通知、補正通知和駁回通知。如果商標被駁回，商標局會發出《商標駁回通知書》。
不同的退款政策。
繳納相關費用是商標受理流程的最後壹個環節。
如果商標被駁回，申請費將不予退還。
壹般情況下，不被受理的商標註冊申請是沒有扣除的。申請手續不全，未按要求填寫申請文件的，未收取商標受理註冊費。