法律分析：1.兩者實質不同：商標爭議實質是對註冊商標在先註冊人的壹項特殊保護措施;商標異議實質是對初步審定的商標所進行的社會異議，包括在相同或類似商品(或服務)上使用相同或近似註冊商標的所有人或在先申請人的異議。
2.兩者內容不同：爭議的內容是權利爭執;而異議的內容只是對初步審定的商標發生異議。
3.提出時間不同：爭議是在被爭議商標核準註冊，即發給商標註冊證五年內提出;而異議是在初步審定，即在《商標公告》上刊登三個月內提出。
4.申請主體不同：爭議人是特定的，即必須是在先註冊人;而異議人不是特定的，可以是任何機關、團體、企業或者個人，包括在先註冊人。
5.提出原因不同：爭議的提出必須是被爭議商標與爭議申請人的商標在相同或類似商品(或服務)上相同或近似;異議除上述原因外，還有違反《商標法》規定的禁用條款或其他規定等。
6.處理機構不同：商標爭議直接向商標評審委員會提出;商標異議向商標局提出。對商標局裁定不服的，可以在收到通知十五日內向商標評審委員會提出復審。
法律依據：《中華人民***和國商標法》
第二條 國務院工商行政管理部門商標局主管全國商標註冊和管理的工作。
國務院工商行政管理部門設立商標評審委員會，負責處理商標爭議事宜
第十五條 未經授權，代理人或者代表人以自己的名義將被代理人或者被代表人的商標進行註冊，被代理人或者被代表人提出異議的，不予註冊並禁止使用。