壹、旗艦店、專賣店、加盟店的區別主要包括:
1，定義上的區別。
旗艦店:天貓旗艦店是商家以自有品牌(商標R或TM狀態)開設的店鋪，稱為品牌的“官方旗艦店”。
店鋪:有品牌授權文件的商家在天貓開的店鋪，在淘寶商城開的這個品牌的店鋪，稱為“品牌店”。
專營店:經營天貓同壹類目兩個或兩個以上品牌商品的店鋪。這樣的店叫“加盟店”。
第二，經營實體的區別在於:
旗艦店:自有品牌企業(品牌必須是申請開店的企業所有或企業法定代表人所有)。
店鋪:獲得品牌商或公司正式授權的企業法人。
加盟店:在中國大陸註冊的企業法人。
三、經營範圍的區別:
旗艦店:天貓旗艦店可以經營同壹品牌、同壹壹級品類下的所有商品，也可以經營多個自有品牌商品，每個品牌屬於同壹實際控制人。
專賣店:天貓專賣店可以經營壹個授權品牌下同壹壹級品類的所有商品，也可以經營多個授權銷售品牌的商品，且每個品牌屬於同壹實際控制人。
加盟店:天貓加盟店可以經營兩個以上的別人品牌商品，也可以既經營別人品牌商品又經營自己品牌商品，還可以經營兩個以上自己品牌商品。
第四，品牌資質的差異
旗艦店:國家商標局出具的商標註冊證或者商標受理通知書，也就是說需要註冊商標。
店鋪:品牌商出具的國家商標局商標註冊證，申請開店的企業提供的品牌商出具的正式授權書。授權書無需地域限制，授權有效期不得早於2015 12 31。品牌所有人為個人的，還應提供本人身份證復印件，並簽署授權委托書。
加盟店:天貓加盟店可以經營自己的品牌，也可以經營別人的品牌。經營自己的品牌，需要提供國家商標局頒發的商標註冊證或商標受理通知書，經營別人的品牌，需要提供完整的授權(即商家提供的授權可以逐級推回給品牌商)。
擴展數據:
天貓的入駐說明:
1.天貓沒有授權任何機構進行招商服務。申請流程及相關收費說明以官方招商頁面為準。
2.天貓有權根據包括但不限於品牌需求、公司運營狀況、服務水平等其他因素對顧客的申請進行退貨；同時，在申請及後續運營階段，天貓有權要求客戶提供其他資質；天貓會根據各行業發展趨勢、國家相關規定和消費者購買需求，不定期更新投資標準。
3.請務必保證您在申請及後續操作過程中所提供的相關資質的真實性(如果您所提供的相關資質是由第三方提供的，如商標註冊證、授權委托書等。，請先核實證件的真實性和有效性)。壹旦發現虛假資質，妳的公司將被列入不誠信客戶名單，天貓將不再與妳合作。
4.天貓不接受個體工商戶或非中國大陸企業的申請。
5.暫時天貓不接受未取得國家商標局頒發的《商標註冊證》或《商標受理通知書》的品牌開業申請(部分類別進口商品除外)，也不接受純圖形商標入駐申請。
天貓商家入駐-店鋪類型介紹