辦公室
負責管理局機關日常事務工作；擬定機關各項制度；負責文秘、會務、機要、保密、檔案等機關日常工作；負責局黨委會議、局辦公會議的組織工作和會議決定事項落實的督查工作及領導批示事項的督查督辦；負責局重要文件的起草工作；負責局黨政信息、來信來訪、政務公開和機關後勤管理工作。
組織宣傳和勞動保障科
負責落實局黨委和市有關部門組織、人事、宣傳、教育、創建、統戰等工作；指導檢查基層黨組織思想、組織、作風建設工作；做好幹部教育、培訓、考核、任免、獎懲工作及後備幹部的培養、選拔工作；落實黨的統戰政策和宗教民族政策；研究制定商務人才發展規劃；負責機關和直屬事業單位機構編制、人事管理和教育培訓等工作；指導直屬企業的勞動、用工、保險工作，負責勞動工資統計工作；協同有關部門做好勞動爭議、勞動仲裁和工傷事故處理；負責局機關離退休幹部服務和管理工作，指導所屬單位老幹部和企業協保中心工作。
計劃財務科
研究編制全市內外經貿中長期計劃及年度計劃調控目標；負責國內外貿易和國際經濟合作宏觀運行狀況的監測分析；承擔局歸口的各項業務資金、專項基金等使用和管理工作，編報預決算；貫徹落實國家出口退稅等促進對外貿易的財稅金融政策，辦理出口退稅稽核；指導外經貿企業的外匯管理和核銷工作；負責全市國內外貿易統計工作、全市各經濟成份商品流轉、流通加工、餐飲服務業有關財務、統計工作；指導監督所屬單位會計、統計法規和相關財會制度的執行，協調落實財政、稅務、審計、金融的各項政策；根據授權負責國有資產管理監督工作；負責商業會計學會的日常工作。
指導所屬企事業單位內部審計，協調處理重要審計事項，並開展各類專項審計工作。
綜合法規科（商務綜合執法辦公室）
研究經濟全球化、區域經濟合作、現代市場體系和現代流通方式的發展趨勢並提出對策建議；研究擬定國內外貿易流通體制改革的意見和建議；研究國家、省和市關於內外貿及外商投資企業的政策、法規，提出貫徹意見和建議；組織起草有關國內外貿易、國際經濟合作、外商投資的各項促進政策的意見；組織起草關於商務的地方性法規、規章草案；承辦有關行政復議和行政訴訟工作；提供企業法律咨詢服務，指導企業法律顧問工作，審議企業改革方案並指導實施；配合有關部門開展普法教育和法規宣傳工作；承擔全市畜禽定點屠宰、酒類流通管理、成品油、化危品、典當拍賣、二手車流通、報廢汽車回收、再生資源回收以及商業特許經營管理等執法職責；負責市12312商務舉報投訴服務工作。
流通管理科
承擔商貿行業服務管理工作，研究商業營銷方式的改革，推進商業業態和流通組織的創新；推動流通體制改革和連鎖經營、商業特許經營、物流配送等現代流通方式的發展，推廣先進流通技術；負責對零售業、食品加工業及食鹽、肉類、食糖、酒類、汽車流通、報廢汽車拆解等特種商品和特殊行業實施監督管理；負責“三綠工程”的管理工作；負責城鄉商業網點規劃、管理和商貿重點項目工作；參與住宅配套的商業用房建設規劃及管理工作；負責營銷中的商品質量、計量、物價、品牌管理。監測分析市場運行、商品供求狀況，調查分析商品價格信息，進行預測預警和信息引導；承擔建立健全生活必需品市場供應應急管理機制相關工作；承擔重要消費品儲備（肉類、食糖、小包裝食品等）管理和市場調控的有關工作；承擔酒類流通管理、市“萬村千鄉市場工程”試點工作領導小組辦公室、市生豬定點屠宰領導小組辦公室的日常工作。
市場秩序科
承擔牽頭協調整頓和規範市場經濟秩序的相關工作；推動商務領域信用建設，指導商業信用銷售，建立市場誠信公***服務平臺；參與組織打擊侵犯知識產權、商業欺詐等工作；負責全市加油站（點）規劃的編制、實施和對成品油市場的監督管理；抓好“百城萬店無假貨”活動，承擔市整頓和規範市場經濟秩序領導小組辦公室、市成品油市場整頓工作領導小組辦公室、市創建“三信三優”活動領導小組辦公室日常工作。
市場體系建設科
組織擬定健全規範市場體系的政策；協調打破市場壟斷、行業壟斷和地區封鎖的有關工作；牽頭組織規範零售企業促銷行為；指導大宗產品批發市場、集貿市場規劃和商業體系建設；推進農村市場和農產品流通體系建設；制定服務業的發展規劃，研究擬定服務業改革、發展政策，承擔服務業的行業管理工作；按有關規定對拍賣、典當、租賃、會展和舊貨流通等新型服務業的行業指導和監督管理；負責商貿中介組織及行業協會的管理、規範運作和發展；組織實施國家、省和市安排的有關流通領域重大投資項目；指導社區商業發展、流通領域節能降耗工作，提出促進商貿中小企業發展的政策建議；指導再生資源回收工作；負責商貿行業從業人員培訓和技術等級鑒定工作。
外資外事科
研究擬定全市外商投資促進政策，指導全市外商投資工作，分析、研究全市外商投資情況，定期向市政府、省商務廳報送有關動態；貫徹執行國家、省和市外商投資的政策、管理規章，參與制定外商投資發展戰略和中長期規劃；依法核準全市限額內的外商投資項目合同、章程及法律特別規定的重大變更，申報限額以上、限制投資和涉及配額、許可證管理的外商投資企業的設立；審批外商投資企業進口設備清單；監督、檢查外商投資企業執行有關法律、法規和合同章程的情況並協調解決發生的問題；指導和管理全市利用外資和外商投資企業工作；負責外商投資統計工作。歸口管理全市經貿外事工作；負責全市各類經貿團組、外派勞務、赴港澳團組審核報批工作；負責市大型對外經貿代表團的出訪安排；辦理全市對外經貿、勞務方面的對外邀請事務；負責國外重要經貿代表團和商務官員來訪的接待工作；承辦機關和直屬單位有關外事工作；聯系涉外經濟商務機構有關事宜；組織、協調外商企業聯合年檢工作；承擔市統籌“五外”工作領導小組辦公室日常工作；聯系市經濟技術開發區工作。
對外貿易發展科
貫徹執行國家、省和市有關對外貿易管理政策，推進外貿促進體系的建設，負責進出口孵化促進工作；執行國家進出口商品管理辦法和目錄；承擔重要工業品、原材料和重要農產品進出口總量計劃的組織實施工作；組織管理進出口商品配額、關稅配額；擬定和執行進出口商品配額招標政策；擬定有關加工貿易促進政策；牽頭擬定服務貿易發展規劃；擬定技術貿易政策和促進服務出口規劃、政策並組織實施；承擔技術進出口管理、服務貿易促進和服務貿易統計工作；會同有關方面擬定並組織實施促進服務外包發展的規劃、政策，推動服務外包平臺建設；擬定促進外貿基地建設的政策措施，推動出口產品國際認證和商標註冊、指導出口品牌建設及管理；協調管理全市貨物進出口經營；指導、協調加工貿易和境外加工貿易等工作；負責全市各類企業外貿經營權的資格審報工作，組織指導企業參加各種外經貿活動；負責進出口貿易中對外理賠、索賠審理和傭金折扣審理工作；負責全市進出口商品管理，核定公司經營權的申報及監督管理工作；負責全市易制毒化學品進出口管理工作。
對外經濟合作科
擬定我市對外經濟合作、人員出境就業管理有關政策和規章制度；負責境外就業職業介紹機構資格認定、審批和監督檢查；依法管理和監督對外投資、對外承包工程、對外勞務合作和設計咨詢等對外經濟合作業務；組織、指導外派勞務人員的綜合培訓；開展對外經濟多雙邊交流與合作，指導重大對外經濟合作項目的實施；承擔外派勞務和境外就業人員的權益保護相關工作；審核市內企業在境外投資開辦企業（金融企業除外）、對外經濟合作企業經營資格；審核各類援外項目實施企業的投標資格，指導援外項目的實施；管理本市接受多、雙邊和有關國際民間機構的無償援助項目及相關的業務；承擔對外承包工程和勞務合作統計工作。
機電產品進出口和科技科
擬定並執行市機電產品進出口、成套設備出口政策措施、中長期發展規劃和年度指導性計劃；負責全市機電出口產品技術更新改造、研發等項目的申報；承擔機電產品貿易促進工作；擬定進口機電產品招標相關辦法並組織實施；提出促進技術貿易的鼓勵政策，管理全市技術、高新技術產品的出口和技術引進工作；組織實施國家有關高新技術產品進出口管理政策和目錄；承擔高新技術產品貿易促進工作；執行國家進出口管制政策，依法頒發兩用物項和技術進出口許可證件；組織多、雙邊工業技術合作；協調國內外貿易和國際經濟合作領域科技發展與技術進步工作。
進出口公平貿易和安保科
承擔進出口公平貿易的相關工作；調查對我市出口商品實施的歧視性貿易政策、法律法規及其做法並進行相應對策研究；建立進出口公平貿易預警機制；指導協調對我市出口商品的反傾銷、反補貼和保障措施的應訴及相關工作；承擔產業損害調查與裁決工作；建立並完善產業損害預警機制，開展產業競爭力調查、產業安全應對與效果評估；指導協調產業安全應對工作；承擔涉及世界貿易組織相關事務的研究、指導和服務工作；依法對經營者集中行為進行反壟斷審查；指導我市企業在國外的反壟斷應訴工作；開展多、雙邊競爭政策國際交流與合作；負責所屬企事業單位的社會治安綜合治理、安全生產和內保工作的指導管理、宣傳教育、督促檢查工作；指導所屬企事業單位的國家安全工作，配合做好保密工作；抓好設備管理和特種設備的運行安全，做好基本建設、倉儲運輸的安全和指導服務工作。
行政審批服務科
負責受理、審核、審批全局所有行政審批與受理服務項目。
信息化科
擬定運用電子商務開拓國內外市場的相關政策、措施，執行國家、省和市國內外貿易和國際經濟合作領域電子商務相關標準和規則；負責進出口預警、市場預測預警和信息發布，組織市場運行和商品供求監測信息化體系建設；實施局電子政務、網上招商；指導全市商貿領域內信息網絡、電子商務、電子政務建設，組織信息化的培訓與交流。