壹． 申請階段
需要準備的材料：
1. 申請人的名稱地址
2. 商標的指定類別以及商品/服務
3. 清晰的商標圖樣（彩色商標需指定顏色，若商標為無設計的純文字內容，那麽不需要圖片化，僅提交文字即可）
4. 優先權文件（若有）（優先權文件可以在申請日起三個月內補交）
在申請階段，是不需要申請人提交事務所委托書以及主體資格證明等文件。
提交申請後，日本特許廳會先給予申請號，並公開該申請。在形式審查有無文件缺失後會進入實質審查階段。
日本特許廳接受壹標多類的申請，申請階段官方費用為首類別12000日元，第二類別起每類別8600日元。
二．審查階段
日本商標的初審階段，主要是判斷該商標的申請是否符合日本商標條例的要求，以及是否存在與已有商標重復或者雷同的情況。
根據審查結果下發駁回通知或者核準註冊的通知。
接到駁回通知書後，申請人如果不予答復，日本特許廳會正式下發駁回決定的通知。
申請人如果選擇答復駁回通知，需要提交意見書或者補正書。收到申請人提出的意見書或者補正書後，日本審查員繼續審查或者直接給出駁回決定。如果再次收到駁回決定，申請人還可以繼續提交復審請求。
在沒有收到駁回通知的情況下，從申請到收到核準註冊通知，大約需要6到8個月時間。
三．註冊階段
日本特許廳下發核準註冊通知後，申請人需要在收到核準通知之日起30天內繳納註冊費用。申請人進行繳費後即獲得商標的註冊，由日本特許廳發布公告。
申請人可以選擇壹次性繳納10年的保護期官方費用，也可以根據實際情況，選擇繳納5年保護期官方費用。
註冊階段費用明細：
10年保護期官方費用為28200日元/類別
5年保護期官方費用為16400日元/類別
通常繳納註冊費後壹個月內會下發註冊證並發行商標公報，發行之日起兩個月內，任何人都可以提出異議申請。