公司建立了江蘇省發改委認定的電力自動化R&D中心、軟件工程R&D中心、江蘇省數據管理與信息集成技術工程研究中心、江蘇省科技廳認定的江蘇電力電氣化嵌入式軟硬件工程技術研究中心，並與東南大學合作建立了東大-金枝電力自動化研究中心。公司直接從事R&D的專業人員超過150人，工程技術人員超過300人。2006年，經人事部批準成立博士後科研流動站。同年，公司通過了CMMI L3的正式評審，標誌著金枝科技的軟件開發能力和項目管理達到了國內領先水平。