2000年3月，根據中國石油化工集團公司改制上市戰略規劃，原九江石化總廠壹分為二，主營業務全部劃歸中國石油化工股份有限公司，成立中國石油化工股份有限公司九江分公司。非主營業務部分保留中國石化集團九江石化總廠名稱，形成總廠與分公司(簡稱合並為九江石化)並存的新體制。
2007年，根據中國石油化工集團公司總體改革安排，九江石化總廠將於9月20日前完成總廠改制，組建中國石油化工集團資產經營有限公司九江分公司，撤銷中國石油化工集團九江石化總廠。中國石化集團資產經營有限公司九江分公司於5月22日在工商註冊成立。