寧安城際鐵路在南京南站正線連接仙西聯絡線，並與滬寧城際仙林站相連，所以寧安城際鐵路可以直通列車到上海，不會出現倒線、切正線等問題。
而寧安城際在南京南站不與京滬高鐵、寧杭高鐵、和寧鐵路相連，只能站內換乘。
寧安城際和何復高鐵在銅陵附近有聯絡線相連，但目前只建了西北聯絡線，可以通過西部的安慶、池州、銅陵經貿高鐵北上合福甚至更遠到北京，而東部的馬鞍山、安慶就更慘了。