抵押的固定資產屬於股權質押的公司:這種情況下，將固定資產抵押給銀行是妳所指企業的經濟行為，將全部股權質押給銀行是妳所指企業股東的經濟行為，法律並不禁止；此外，銀行將分別審查兩個不同申請人的貸款。所以兩者並不沖突，也不存在違法的情況。
如果銀行對固定資產行使質押權和拍賣權，質押的股權不就沒了嗎？
行使抵押權後，銀行獲得了抵押物:固定資產，拍賣權，質押股權依然存在。
銀行行使質押權後，獲得了質押物:股權，拍賣權，企業易主。
實際情況是，二次貸款的銀行會根據具體情況考慮潛在的風險，再決定是否放貸，不管誰先貸。