重慶市環境科學研究院成立於1976年4月，自2015年1月起正式獨立運行，是重慶市環境保護局直屬事業單位，重慶市科委管理的獨立科研機構。
2008年以來，先後承擔了國際合作項目、國家級項目、地方部門資助等科研項目250余項，其中國際合作項目6項、國家級項目15項、省部級項目90項、地方部門項目100余項。榮獲環境保護部科技二等獎3項、環保部科技三等獎1項、重慶市科學技術進步獎4項、重慶市自然科學獎1項。***發表學術論文458篇，其中國外學術刊物上***發表32篇，EI/SCI/SSCI收錄31篇；國內核心刊物上***發表177篇；獲得國內發明專利13項，還有3項正在申請中。
2011年以來，完成的環境影響報告書，全部通過國家、重慶市或區縣審批，涉及化工石化醫藥、建材火電、社會區域、農林水利、冶金機電、交通運輸、輕工紡織化纖等七大類別。完成環境保護部審批的環境影響報告書3項，即重慶華電奉節電廠“上大壓小”新建項目、重慶中電投合川電廠“上大壓小”第二臺機組項目、重慶市安穩電廠擴建工程。