專利申請權與專利權的區別有：含義不同，專利權指的是申請的發明創造符合專利法授權的條件，而獲得的獨占性的權利。專利申請權指的是發明創造向國家知識產權局提出申請專利的權利。獲得的時間不同，專利權是在最終授權後獲得，專利申請權是在提出專利申請到專利被授權或駁回之前的權利。
《民法典》第三條，國務院專利行政部門負責管理全國的專利工作；統壹受理和審查專利申請，依法授予專利權。省、自治區、直轄市人民政府管理專利工作的部門負責本行政區域內的專利管理工作。