1關於A公司，妳們無需另外簽訂協議,A公司也無權對外進行專利轉讓和許可。但是a公司使用購買的專利設備當然是可以的。貴公司可以同A公司約定工藝流程專利的使用範圍，即只限於a公司現有工廠，而不包括新工廠。
2妳們應該同b公司簽訂技術許可協議。我不知道具體的情況，但是有可能出現專利法中規定的在先使用原則的即在專利申請日之前，已經制造相同產品、使用相同方法或者已經做好制造、使用的必要準備，並且僅在原有範圍內繼續制造、使用的，不視為侵權行為。