本發明涉及壹種多糖定量檢測方法及系統。該方法通過色譜柱分離多糖，水解後與熒光衍生化試劑反應，用熒光檢測器測定生成的熒光衍生物，得到多糖的含量。本發明的多糖檢測系統依次包括高效液相色譜柱、水解反應器、熒光衍生反應器、冷卻管、熒光檢測器和工作站或記錄裝置。本發明檢測系統通過先水解多糖，再與熒光衍生試劑反應，大大提高了檢測靈敏度，適用於各種類型多糖含量的定量檢測，檢測限可達幾十ng。