本發明涉及壹種多糖定量檢測方法及系統。該方法是先將多糖經色譜柱分離後進行水解再與熒光衍生化試劑反應，通過熒光檢測器對生成的熒光衍生物的測定，獲得多糖的含量。本發明用於多糖檢測的系統依次包括高效液相色譜柱、水解反應器、熒光衍生化反應器、冷卻管、熒光檢測器和工作站或記錄裝置。本發明檢測系統通過先對多糖進行水解，再與熒光衍生化試劑反應，大大提高了檢測的靈敏度，適合於各種類型的多糖含量的定量檢測，其檢測限可達幾十ng。