關鍵問題是要搞清楚軟件著作權與專利權的含義區別:軟件作品完成後，無論計算機軟件著作權登記與否，都將依法產生著作權。為了獲得明確的證據，防止以後的糾紛，可以申請軟件著作權登記。只有申請了，專利權才能被授予。
計算機程序具有作品性質，其代碼表達受著作權法保護。版權不保護創意本身，只保護形式。
發明專利申請:
1，涉及自動技術處理過程的發明專利申請；
2.涉及改進計算機內部運行性能的發明專利申請；
3.涉及測量或計算機程序測試的發明專利申請。這些方案與相關的產品、設備、計算機或測量裝置相結合，形成壹個完整的技術方案，可以申請專利。計算機程序應獨立完成並具有原創性。只要是原創作品，無論是否與已發表作品相似，都可以獲得獨立版權。專利權只授予第壹申請人，要求有新穎性和創造性。
軟件系統先申請軟件著作權，就可以申請專利。雖然先申請了軟件著作權，但並未公開軟件系統的技術核心、構思和模型。如果申請了專利，軟件著作權的申請也不會失去新穎性，因為沒有新穎性，只有獨創性。