經過長期的建設與發展環境科學與工程學院已形成4個穩定的學科方向：（1）化學品汙染與控制技術；（2）廢棄物綜合利用與傳統行業清潔生產關鍵技術；（3）廢水、廢氣的安全處理技術；（4）微量汙染物分離與分析技術。環境科學與工程學院是國家第壹批取得環評資質的單位（國環評證乙字第2801號），並取得廣東省清潔生產技術服務單位證書（證書編號20101010）。學院下設環境科學系、環境工程系、生物工程系、實驗中心、環境與資源研究所。
近三年學院承擔各類科研項目220多項，其中包括國家科技重大專項1項、國家自然科學基金6項；廣東省教育部產學研合作專項資金18項、廣東省重大科技專項3項，廣東省自然科學基金3項、廣東省科技計劃9項等縱向科研項目及環境影響評價、清潔生產審核等橫向科研項目180多項。年均科研經費超過1000萬元，獲專利授權10項，發表學術論文250多篇，其中被SCI、EI收錄論文70多篇。2001年的“硫化礦電位調控浮選理論與實踐”榮獲國家科技進步壹等獎。近五年獲得省部級科技進步獎6項，承擔省級以上教改教研項目3項，發表教改教研論文36篇，網上運行學習網站1個，獲得校級教學成果獎4項，建成校級教學團隊1個，主編參編教材3本，26人次獲得各級大學生科技競賽獎。