〔1〕從行政序列上看:國家知識產權局(SIPO)屬於國務院直屬事業單位，為副部級單位；北京市知識產權局是科級單位。與工商局垂直管理(商標局管轄)不同，地方知識產權局由地方政府設立，行政級別不完全統壹。有些地方設有官方部門，如北京、上海、浙江。有的地方實行副廳級標準，比如安徽、河南、山西。
[2]業務指導方面，在業務實踐中，國家局與地方局存在業務指導關系。
[3]就案件關系而言:無效案件在先，侵權案件在後；國家知識產權局(專利復審委員會)維持涉案專利有效後，北京市知識產權局認定蘋果公司侵犯了涉案專利；在程序上，它們之間沒有沖突；實質上，可能的分歧是另壹回事。
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