基因組學更像是壹張藍圖，可以告訴我們可能會發生什麽；而蛋白質組學可以告訴我們到底發生了什麽，正在發生什麽。單純解碼基因組很難提供蛋白質的翻譯後修飾、定位、相互作用等信息，這些信息包含了生命活動如何展開、病理過程為何發生等最直接、最重要的信息。
在癌癥的狀態下，基因組與蛋白質組的關系頗似壹個典故——在篝火中扮演諸侯:西周末年，周幽王為鮑波公主而笑，無緣無故地點燃了邊境所用的烽火臺，使得各路諸侯長途跋涉，爭相救援，使幽王違背了對諸侯的諾言，死於西周。
蛋白質就像DNA圖紙中的“烽火臺”。DNA只能設計烽火臺的結構，以及建在哪裏。但現實造成的烽火臺與圖紙的偏差，並沒有體現在DNA中。更重要的是，絲毫沒有出現遠超DNA圖紙中壹般偏差的“篝火打王子”的情況。