第壹，性質不同
1.花色苷是自然界中廣泛存在於植物中的壹種水溶性天然色素，是花色苷水解得到的苷元。
2.原花色素是廣泛存在於植物中的壹大類多酚化合物的總稱。
第二，角色不同
1.花青素:壹種活性分子，不僅使植物呈現五彩繽紛的顏色，還具有降低酶活性、抗突變等保健功能；既可作為食品中的營養強化劑，也可作為食品防腐劑替代苯甲酸等合成防腐劑，還可作為食品著色劑用於普通飲料和食品中，滿足了人們對食品添加劑天然、安全、健康的普遍要求。
2.原花青素:具有較強的抗氧化和自由基清除作用，能有效清除超氧陰離子自由基和羥基自由基，參與磷酸和花生四烯酸的代謝和蛋白質磷酸化，保護脂質免受過氧化物損傷；是壹種強有力的金屬螯合劑，能在體內形成惰性化合物；保護和穩定維生素C有助於維生素C的吸收和利用。
第三，來源不同
1.花色苷廣泛分布於開花植物(被子植物)中，其在植物中的含量因品種、季節、氣候和成熟度的不同而差異很大。
2.原花色素:存在於許多植物的皮、殼、種子、核、花和葉子中。
百度百科-花青素
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