1. 粗純：將制備抗體的血清或是腹水，細胞上清，直接用鹽析法進行處理，這樣可以將這些物質裏面的其他雜質去掉，獲得蛋白的成分，但是由於是粗純，裏面會混有大量的其他蛋白，這樣獲得的抗體，純度較低，用於實驗中背景比較高。
2.通用型純化：用抗體結合蛋白Protein A，Protein G或者Protein L。因為不同來源的抗體和這些抗體結合蛋白的結合能力不同，所以需要根據抗體來源選擇使用哪種抗體將誒和蛋白最好。對於有壹些單鏈抗體，則多半使用protein L來進行純化。經過抗體結合蛋白的親和純化後，溶液中基本只保留了抗體的成分，其他蛋白都去掉了，抗體純度可以比較高。相對來說，這種方法是大規模抗體制備中，用得最多的純化方法，很多抗體公司都采用這種方法來對抗體進行純化。
3.特異型純化：但是有些抗體，需要純度特別高，特異性特別好，就不能簡單采用上述兩種方法進行純化了。必須要通過將抗原固定制備成特異的親和純化柱，再純化抗體。這個時候得到的就全是針對壹種抗原的抗體了，特異性最好。當然，由於牽涉到抗原固定等操作，成本相應是最高的。