1.索要付款憑證:要求對方公司提供付款憑證，如銀行轉賬記錄、電匯憑證等，可以作為確認對方已付款的依據，也可以作為入賬的憑證。
2.簽訂合同:確定在合作專利開發合同中明確約定雙方權益和支付責任，並在合同中註明對方不開發票的入賬方式。
3.開具收款證明:可以自己開具收款證明，在上面記錄具體金額和付款日期，請對方確認並簽字。