馬超群教授現任中國復雜系統研究會副秘書長、中國決策科學研究會常務理事、湖南省系統工程學會常務理事兼副秘書長、湖南省青年系統工程學會副會長、湖南省社會科學工作者聯合會常務理事、湖南省信息研究會常務理事。
馬超群教授主持或參與國家自然科學基金重大項目、國家社會科學基金項目、國家“863”計劃項目等10多項國家課題和20多項省部級項目的研究。為國家和地方各級政府以及超大型企業和金融機構提供20余份政策研究報告；在IJTAF、IEEE等國內外重要期刊發表學術論文180余篇，學術著作4部，其中在美國著名的SIAM發表英文學術專著1部，被SCI、EI、ISTP收錄論文20余篇，用英文撰寫國際會議文集1部，申請專利1件。獲高等學校科技進步壹等獎1項，湖南省科技進步二等獎2項，湖南省社會科學優秀成果二等獎1項，中國鐵道學會科學技術三等獎1項，其他省部級科研獎勵4項。組織了三次國際學術會議，並多次作為特邀代表在國際國內學術會議上做主題發言。