二者都是從紅藻類植物（壹般為石花菜）中提取出來的，瓊脂糖用於生產凝膠類產品。例如我們做的電泳凝膠。瓊脂又稱凍粉，用作細菌培養基、食品凝膠劑和紡織業的漿料。
就結構來說，瓊脂是由瓊脂糖（agarose）和瓊脂果膠（agaropectin）組成的。瓊脂糖是線性的多聚物，基本結構是1,3連結的β-D-半乳呋喃糖和1,4連結的3,6-脫水α-L-半乳呋喃糖。瓊脂果膠是由許多更小的分子組成的異質混合物。它們的結構相似，但帶硫酸根和羧基組分，凝膠能力差。