宋世鵬先生建樹卓著、獲獎頗豐，具有代表性的獎項有：
1997年，獲國家醫藥科技進步壹等獎（國家級)，深圳市科技進步壹等獎，全國第三屆科技交流大會金獎（國家級）
2005年，上海市最具活力科技創業者獎
2006年，中國國際博覽會創新獎（國家級）
2008年，上海市科學技術獎等