1、繳費不同：銷售軟件即征即退可以作為不征稅收入，在計算納稅所得額中從總額中減去，不需要付費。特許權使用費需要付費。
2、支付費用方不同：銷售軟件即征即退是不需要賣方付費了。特許權使用費所得，是指個人提供專利權、商標權、著作權、非專利技術以及其他特許權的使用權取得的所得，是買方付費。