1、異硫藍（分子量543.6KD）是第1個被美國食品藥品監督管理局批準的藍染料示蹤劑，異硫藍分子量均較大，與蛋白結合力很弱，註射後快速進入淋巴管，較少擴散到周圍組織和入血。優勢在於染色相對較深，不良反應發生率低。缺點在於維持淋巴結藍染狀態的時間短，價格昂貴，國內較難購得。
2、亞甲藍（分子量373.9KD）是國內使用較為普遍的藍染料示蹤劑。由於分子量較小，亞甲藍註射後很快擴散到周圍組織，部分入血，僅少量進入淋巴管，並在SLN內濃集。亞甲藍的優點在於價格低廉，操作直觀，易於推廣。缺點在於染色相對較淺，並且不良反應發生率相對較高。亞甲藍，異硫藍和專利藍具有相似的成功率和假陰性率。在國內市場尚無進口藍染料供給的情況下，亞甲藍是有效、可靠的替代品。
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